Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ2O43526 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ2O43526 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms