Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA2O43364 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA2O43364 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms