Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTIFO43310 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTIFO43310 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTIFO43310 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTIFO43310 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTIFO43310 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTIFO43310 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTIFO43310 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTIFO43310 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTIFO43310 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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