Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRTM2O43300 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRTM2O43300 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms