Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPAA1O43292 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms