Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHADO15335 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHADO15335 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHADO15335 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHADO15335 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHADO15335 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHADO15335 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHADO15335 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHADO15335 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHADO15335 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHADO15335 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHADO15335 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHADO15335 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHADO15335 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHADO15335 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHADO15335 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms