Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF6O14896 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF6O14896 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF6O14896 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF6O14896 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF6O14896 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF6O14896 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF6O14896 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF6O14896 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF6O14896 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF6O14896 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF6O14896 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF6O14896 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF6O14896 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF6O14896 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF6O14896 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF6O14896 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF6O14896 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF6O14896 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF6O14896 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF6O14896 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF6O14896 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF6O14896 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF6O14896 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF6O14896 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF6O14896 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF6O14896 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF6O14896 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF6O14896 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF6O14896 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF6O14896 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF6O14896 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF6O14896 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF6O14896 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF6O14896 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF6O14896 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF6O14896 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF6O14896 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF6O14896 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF6O14896 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF6O14896 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms