Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms