Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39AO00148 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX39AO00148 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms