Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H3BQV1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H3BQV1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H3BQV1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
H3BQV1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQV1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQV1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQV1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQV1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQV1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQV1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQV1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQV1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQV1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQV1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQV1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQV1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQV1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQV1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQV1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQV1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQV1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQV1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQV1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQV1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQV1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQV1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQV1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQV1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQV1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQV1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQV1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQV1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQV1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQV1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQV1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQV1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQV1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQV1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms