Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQF6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQF6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQF6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQF6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQF6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQF6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQF6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BQF6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BQF6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BQF6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms