Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNX3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNX3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BNX3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BNX3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BNX3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BNX3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BNX3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3BNX3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3BNX3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3BNX3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3BNX3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H3BNX3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H3BNX3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms