Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms