Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L20D6RJB6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L20D6RJB6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms