Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF879B4DU55 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF879B4DU55 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms