Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms