Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPOPA6NHQ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms