Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PALM3A6NDB9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALM3A6NDB9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms