Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PPC1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPC1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms