Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 AL050344.1-202ENST00000429666 614 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 LRRC23-205ENST00000429740 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 GAPDHP2-201ENST00000432206 998 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 PKMP4-201ENST00000523134 306 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 AC099804.1-201ENST00000623105 714 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 PPP2R5C-202ENST00000334743 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 SCRN3-202ENST00000409673 1788 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 AL031663.3-201ENST00000617473 1794 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 METTL22-202ENST00000381920 4984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 MMP2-208ENST00000570308 3235 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 LMOD3-203ENST00000489031 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 SPATA18-201ENST00000295213 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RORCP51449 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RORCP51449 GOLGA2P5-202ENST00000304813 3105 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RORCP51449 AP000911.1-203ENST00000529070 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC012613.2-201ENST00000523176 4533 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RORCP51449 RIPOR2-201ENST00000259698 5471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RORCP51449 SLC26A5-204ENST00000356767 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RORCP51449 DPP6-201ENST00000332007 3768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RORCP51449 ARMC8-217ENST00000481646 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RORCP51449 CD300LG-202ENST00000317310 2758 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 COX15-202ENST00000370483 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 PCDHGA10-201ENST00000398610 4617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 EOMES-203ENST00000461503 2080 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 LINC01346-201ENST00000412674 3242 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 NSUN7-202ENST00000381782 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CES5A-206ENST00000521992 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 TTTY5-201ENST00000400581 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CLIP1-213ENST00000540338 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CEP89-204ENST00000590597 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 NCAPD3-214ENST00000534548 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AMPD2-202ENST00000342115 3728 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 SLC36A3-202ENST00000377713 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 ZAN-204ENST00000546292 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 TRPM1-201ENST00000256552 5514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CLDN17-201ENST00000286808 1193 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AL627313.1-201ENST00000428860 238 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AL663070.1-201ENST00000438210 725 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 SLC25A39P1-201ENST00000444461 1065 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC132008.2-201ENST00000453454 956 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 LINC02051-201ENST00000456535 690 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC074344.2-201ENST00000502846 565 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AP006437.2-201ENST00000528000 345 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC018697.1-201ENST00000577354 472 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 TMEM205-204ENST00000586218 593 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC005261.3-201ENST00000597973 1045 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 AL512380.1-201ENST00000637411 2106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 SH2D4A-201ENST00000265807 3352 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 LEXM-202ENST00000371273 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 ANKRD46-206ENST00000520552 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RORCP51449 CDH8-211ENST00000584337 3986 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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