Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAMTA1Q9Y6Y1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms