Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00312Q9Y6C7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms