Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB13Q9Y5F0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB13Q9Y5F0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms