Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9Y3F1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms