Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2J1Q9Y385 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2J1Q9Y385 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms