Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFR3BQ9Y2G0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms