Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNRC6BQ9UPQ9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNRC6BQ9UPQ9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms