Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP1Q9UPQ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms