Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNMA8BQ9ULN7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNMA8BQ9ULN7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms