Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PNMA3Q9UL41 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms