Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL36

ZNF236, Zinc finger protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF236Q9UL36 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF236Q9UL36 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF236Q9UL36 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms