Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMFRQ9UKV5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms