Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP4Q9UKK3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms