Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRTO4Q9UKD2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms