Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms