Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH22Q9UJ99 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms