Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPXQ9UHP9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms