Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1LQ9UGC7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTRF1LQ9UGC7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms