Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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