Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLKQ9UBT6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms