Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG4Q9UBN1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms