Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRBP1Q9P2E9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
RRBP1Q9P2E9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRBP1Q9P2E9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms