Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms