Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms