Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MSRB1Q9NZV6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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