Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms