Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms