Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH5Q9NX47 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH5Q9NX47 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms