Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLE1Q9NVX2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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