Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms